新疆河流众多，大小河流有570多条，且水量相差悬殊，大部分河流流程短，水量小。
年径流量小于1亿m3的有487条，水量仅83亿m3，而每项流量大于10亿m3的河流仅18条，径流量达584亿m3。全疆地表水总径流量为884亿m3，地下水可开采量252亿m3。
新疆人均水占有量约为全国人均占有量的2.2倍多，居全国第四位，从这个意义上讲，新疆的水资源是相对丰富的，只要解决好水资源时空分布的不平衡，开源节流，合理配置，是可以满足自治区中、远期可持续发展需求的。但相对新疆的土地面积，每km2的平均水量只有4.8m3，居全国倒第三位，这对降雨水稀少、生态脆弱的新疆来说，水资源量确实又是非常紧缺的。
新疆地下水资源，主要来自地表水的转化，山区产生的地下水资源，往往以泉流或渗流形式补给到山区河道内，成为山区地表径流的一部分，所以山区地下水资源大多已包括在出山口地表径流以内了。新疆可利用的地下水资源量，主要是指平原地区的地下水，总补给量约为395亿m3，其中可开采量约为252亿m3。
受自然地理条件的影响，河流分布于各盆地的周围，由山区流向内部平原区构成向心水系，绝大部分属于内陆河系，唯有北部的额尔齐斯河流入哈萨克期坦的鄂毕河后注人北冰洋，西南部的奇普恰普河流入印度河最后注和印度洋。在内陆中有伊犁河、额敏河流入哈萨克斯坦水资源的分布北疆多于南疆，西部多于东部，迎风坡多于背风坡。如：北疆面积只占27%，地表水资源量却占52%；南疆面积占73%，而地表水资源量却占48%。
新疆的河流主要靠高山冰川和积雪补给，三大山系的冰川蕴藏量约有2.6万亿m3，是一个巨大的固体水库，对新疆的地表水径流量起着十分重要的调节作用，平均每年的冰川融水达178亿m3，占新疆地表年径流量的22.5%。水资源总量比较稳定，年际变幅较小，变差系数Cv一般在0.1--0.5之间。但年内分配不均，变化规律较复杂，一般都具有在夏季水量集中的特点，最大的四个月水量（6、7、8、9月）占整个年径流量的70--83%，大部分河流的春季水量较小，且大多调节能力弱，不能满足农业的春灌需要，常出现春旱，少数地区秋季也缺水。春旱、夏洪、盐碱、风沙、缺电即为新疆的"四害一缺"。新疆绝大多数内陆河流程短、纵坡大、山区暴雨洪水对平原区的破坏能力极强，防洪任务十分艰巨。
新疆在各河系出山口以下的平原绿洲地带，修筑了大量的引、蓄水工程，除伊犁河、额尔齐斯河等外流以外，其余水量的70%--85%均已被引用。但由于新疆长期的水利投入不足，工程老化，又不配套，绝大多数河汉几无控制性调蓄工程，加之农业生产技术和管理水平较低，灌溉定额过高，全疆平均灌溉定额731m3/亩，渠系有效利用系数仅为0.46，仅在输水环节上水资源的浪费就非常严重。这是造成土地次生盐碱化的主要原因。在用水比例上，全疆农业用水是大头，占到98.2%。
此外，新疆每年出境水量230亿m3左右，占总水量884亿m3的26%左右，主要集中在伊犁河与额尔齐斯河，这些河流目前的水资源开发利用程度很低，流域土地开发及生产水平也很低。尽快利用出境水量，实现对当地水土资源开发及向相邻缺水区域调配，也是新疆水资源开发利用的近、中期方向。 |
