2002年6月，水利部水利水电规划设计总院在北京主持召开会议，对珠江委提出的《珠江防洪规划纲要（初稿）》进行了讨论。

    会后，珠江委根据会议纪要精神和讨论意见，提出了《珠江流域防洪规划（送审稿）》，并于2003年6月和2004年9月先后两次征求有关省（自治区）的意见，在此基础上做了进一步的修改完善。

    2005年5月29日～31日，水利部组织召开珠江流域防洪规划审查会，国务院有关部委和流域内各省（自治区）的代表及特邀专家审查通过了《珠江流域防洪规划（送审稿）》。

    2005年11月，水利部以办规函[2005]558号征求国务院有关部门、解放军总参谋部、流域内各省（自治区）人民政府的意见。

    2006年1月，受国家发展和改革委员会的委托，中国国际咨询公司对《珠江流域防洪规划（征求意见稿）》进行了评估。根据国务院各有关部门、解放军总参谋部、流域内各省（自治区）人民政府的反馈意见，珠江委再次对《珠江流域防洪规划（征求意见稿）》进行了修改完善。

    2007年4月27日，国务院批复《珠江流域防洪规划》。